关键地球物质循环与成矿全国重点实验室依托南京大学，于2025年1月通过优化重组获批为全国重点实验室。实验室前身内生金属矿床成矿机制研究国家重点实验室（南京大学）是全国第一个从事金属矿产资源研究的国家重点实验室。历经三十余年发展，实验室在花岗岩-火山岩成岩成矿、稀有金属成矿机制、重大地质事件与物质循环、微区微束和同位素分析，以及地学大数据和高性能计算等领域形成理论和技术特色。
实验室面向矿产资源保障国家战略和地球物质循环科学前沿，依托地质学国家一级重点学科，“地质学”和“矿业工程”两个 “双一流”学科，围绕关键地球物质循环与成矿动力学、圈层相互作用与金属成矿机制、物质循环-成矿示踪与利用新技术等方向开展研究，创新地学科研范式，开展关键地球物质“深部-表层”的跨圈层循环融合研究，打造物质循环和金属成矿领域的国家战略科技力量。
