南京大学高性能计算中心目前主力计算集群为2017年4月正式开放运行的联想Flex集群系统（风冷）与2025年上线运行的“蓝鲸一号”液冷计算平台。Flex集群系统含906台CPU计算节点（双路Intel Xeon E5-2680v3）、4台GPU计算节点（每节点2块K40c GPU卡），4台登录服务器，1台IBM ESS GL6存储、1台SSD高速并行存储，计算网络采用两台Mellanox 648口Infiniband FDR 56Gb/s交换机，作业调度系统为LSF。此系统理论CPU计算峰值870万亿次/秒（不含GPU），Linpack实测值 79.62%。

中心Flex集群的详细参数如下：

“蓝鲸一号”液冷计算平台主要参数如下：

l 含360台液冷计算节点与2套高性能存储系统，室内整体占地面积不到三十平方米，展现出卓越的空间利用效率。

l 理论双精度浮点计算峰值约2580万亿次/秒，在全机实测中表现优异，HPL（高性能Linpack基准测试）效率高达88.25%。

l 采用集成高带宽内存（HBM）的中央处理器，显著提升了数据密集型科研应用的运算性能。

l 采用高速低延迟IB并行计算网络，任意两个计算节点间200Gb/s全速互联。

l 配备高稳定性并行存储系统，未加载文件系统缓存条件下实测持续读写带宽20GB/s以上，裸容量4PB。

l 配备纯NVMe架构超快并行存储系统，持续读写带宽高达300GB/s，裸容量1.6PB，能够极大满足大规模并发数据处理需求，为复杂数值模拟、人工智能训练、生命科学、材料计算等高读写负载研究提供了强大支撑。