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新加坡科技研究局基因组研究所曹娇博士应邀作报告

发布于:2024-10-27文章阅读数:

2024年10月27日上午,新加坡科技研究局基因组研究所曹娇博士应南京大学环境与健康研究院邀请,来到南京大学苏州校区进行学术交流,并作了题为“空间转录组测序解析肿瘤微环境-Spatial transcriptome sequencing resolves the tumor microenvironment”的精彩报告。本次报告由环境与健康研究院学院助理教授王玉琴主持。王玉琴老师向参会师生们介绍了曹娇博士的研究方向和学术成就等,并为此次报告致辞。本次学术报告吸引了来自南京大学环境与健康研究院和其他院系约30余名师生参加。

在本次报告中,曹博士主要分享了她们开发的兼具高分辨率和高灵敏度的Decoder-seq技术。在将多孔微球和微流控技术引入mRNA的富集流程后,显著提高了空间转录组学对低丰度转录样本,如小鼠绣球中嗅觉受体基因的检测能力。并基于该技术成功构建了小鼠海马体近单细胞分辨率的空间图谱,揭示树突mRNA富集。此外,该技术还适用于肿瘤临床样品,用于确定肿瘤中空间梯度的基因表达,有助于在临床诊疗解析肿瘤微环境。最后,曹博士还为在场师生分享了在求学过程中的经历,使在场师生收益匪浅。

本次报告内容丰富、精彩纷呈,引起了在座师生的广泛兴趣。报告结束后,曹博士同与会师生就空间转录组学技术,测序技术靶向探针的结合,论文的写作与发表等相关问题进行了热烈的交流与讨论。

曹娇博士简历:

曹娇,南京大学大学化学系博士,上海交通大学医学院附属仁济医院博士后,现就职于新加坡科技研究局基因组研究所。主要研究方向为新型空间组学技术的开发及应用,成功开发了兼具高灵敏和高分辨率的空间转录组学技术,并实现人肾癌、口腔癌等临床样品的肿瘤微环境解析。先后在Nature Biotechnology、Nature Communication等国际著名期刊发表多篇文章。

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